学校始建于1977年，校名为“南部县南隆区初级中学”，1979年首届招收初、高中各两个班，至1994年一直维持12个班的办学规模。1993年经省教厅批准更名为“南部县凌云职业高级中学”，直至2002年办学规模不足千人，其中1992年停止普高招生（2000年恢复），1999年停止初中招生（2000年恢复）；2002年11月县委、政府决定将南部县凌云职业高级中学更名为南部县第三中学并保留原职中牌子，2007年2月南部县第三中学成功创建为“南充市示范高中”，2006年11月经省教厅批准将南部县凌云职业高级中学更名为“南部县职业技术学校”并于2010年10月创建为“四川省重点中等职业学校”。
近几年南部三中发展迅猛，完成了由小到大、由弱到强的蜕变，实现了高考本科上线人数连续5年翻番（2010年己达251人，位居全县第三名）、初中教学质量连续4年获南部县综合评估一等奖；50余教师参加市县课堂竞教、专业技能操作竞赛一等奖。
未来的南部三中将致力于内涵发展，借高、初中课改之机大力践行教学改革，使教育教学质量再次跃进；力争三年内迈入“国重”行列；尽快完成本部标准运动场、学生公寓、教学综合楼、实训楼建设，全面启动二校区建设。我们将集全校之智，举全校之力，迅速将学校打造成响誉省内的综合高中。
收费标准
普高：凡考分低于480分，愿到我校就读的考生按以下方法收取择校费
| 分 数 段 | 择校费（元） | 分数段 | 择校费（元） |
| 360---370 | 9000 | 431---440 | 4000 |
| 371---390 | 8000 | 441---450 | 2000 |
| 391---400 | 7000 | 451---460 | 1500 |
| 401---430 | 6000 | 461--480 | 1000 |
职高：凡考生低于最低控制线320分，又愿到我校就读的考生,每低1分收择校费50元，每位考生收录取费600元；计算方法为：择校费=（320－考分）×50元/分+600元。
